دوره 18، شماره 3 - ( مجله مهندسی برق و الکترونیک ایران - جلد 18 شماره 3 1400 )                   جلد 18 شماره 3 صفحات 120-113 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Tarbali T, Majidians S, Kahaei M H. Haplotype Estimation Using Low-Rank Matrix Factorization in Presence of Outliers. Journal of Iranian Association of Electrical and Electronics Engineers 2021; 18 (3) :113-120
URL: http://jiaeee.com/article-1-1007-fa.html
تربالی تینا، مجیدیان سینا، کهایی محمد حسین. تخمین هاپلوتایپ با استفاده از فاکتورسازی ماتریس رتبه‌پایین در حضور داده‌های پرت. نشریه مهندسی برق و الکترونیک ایران. 1400; 18 (3) :113-120

URL: http://jiaeee.com/article-1-1007-fa.html

تخمین هاپلوتایپ با استفاده از فاکتورسازی ماتریس رتبه‌پایین در حضور داده‌های پرت
تینا تربالی ، سینا مجیدیان ، محمد حسین کهایی*
دانشکده مهندسی برق- دانشگاه علم و صنعت ایران- تهران
چکیده:   (1996 مشاهده)
تخمین هاپلوتایپ بر اساس اطلاعاتDNA برای کشف بیماری­های ژنتیکی انسان استفاده می­شود. این مسئله در پردازش ژنومی سیگنال­ها به صورت یک ماتریس رتبه­پایین قابل مدل سازی است که به علت محدودیت­های موجود در خوانش هاپلوتایپ، فقط تعداد کمی از درایه­ها مشاهده می­شوند. در نتیجه یک روش موثر برای بازیابی هاپلوتایپ از مشاهدات ناقص، استفاده از روش­های تکمیل ماتریس است.  در این مقاله به کمک روش­های تکمیل ماتریس، سعی در تخمین هاپلوتایپ از طریق فاکتورسازی ماتریسی شده­است. در مراجع از روش گرادیان کاهشی برای حل مسئله استفاده شده­است. اما در روش های قبلی داده­های پرت نیز در محاسبات وارد می­شود که باعث خطا در تخمین هاپلوتایپ شده است. به عبارتی در این روش­ها به شروط موجود برای ماتریس­های هاپلوتایپ توجه نشده است و این موضوع باعث تخمین داده­های پرت برای هاپلوتایپ شده است. در این مقاله با روش تکمیل ماتریس و با در نظر گرفتن این شروط در ماتریس هاپلوتایپ، یک تابع هزینه جدید به صورت عبارت جریمه برای تخمین هاپلوتایپ معرفی می­کنیم. عبارت جدید اضافه شده به تابع هزینه باعث می­شود که اثر داده­های پرت کاهش یافته و در نتیجه دقت تخمین هاپلوتایپ افزایش می­یابد. نتایج شبیه سازی نیاز کاهش خطای بازیابی هاپلوتایپ را تایید می کند.
واژه‌های کلیدی: تخمین هاپلوتایپ، ماتریس رتبه پایین، تکمیل ماتریس.
متن کامل [PDF 840 kb]   (1091 دریافت)    
نوع مقاله: پژوهشي | موضوع مقاله: مخابرات
دریافت: 1398/7/28 | پذیرش: 1399/9/17 | انتشار: 1400/4/25
ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA
ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License (CC BY NC 4.0) قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به نشریه مهندسی برق و الکترونیک ایران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2024 CC BY-NC 4.0 | Journal of Iranian Association of Electrical and Electronics Engineers

Designed & Developed by : Yektaweb